গফরগাঁও এর উল্লেখযোগ্য নদী ব্রহ্মপুত্র।গফরগাঁও উপজেলা বহ্মপুত্র নদীর মাধ্যমে দ্বিখন্ডিত হয়েছে। নদীর দুই তীর পানি উন্নয়ন বোর্ড কর্তৃক বেড়ী বাধ নির্মাণ করা আছে।

তাছাড়াও গফরগাঁও উপজেলার সীমানা প্রায় তিন দিক নদী দ্বারা বেষ্টিত।

১। পূর্ব দিকে ব্রহ্মপুত্র।

২। দক্ষিণ দিকে কালীবানার।

৩। পশ্চিমদিকে সুতিয়া। এবং

৪। উপজেলার ভিতরে শিলা নদী রয়েছ।